停经40天时，医生检查说怀孕了

问题分析：你好，一般来说 ，在怀孕50多天时候才可以看到孕囊的，你现在怀孕40天看不到孕囊也是正常的。
你可以过几天再到医院检查一下，看看有没有孕囊，如果不想要，你可以在怀孕50天左右到当地正规医院做人流，人流以后要注意休息，不要劳累，不要着凉水，不要性生活，祝健康。

问题分析：你好，你停经40天b超检查，宫内宫外都没有见到孕囊，应考虑为受孕比较晚引起的可能性比较大，但是也应该警惕是不是宫外孕的可能。
建议你应该注意休息，避免过度劳累，可以一周以后到医院复查b超查看有没有孕囊，确定宫内妊娠以后才可以进行流产。