问题分析:根据你的描述,结合患者目前的情况和检查结果,胆囊萎缩与长期慢性乙肝控制不好有关系,目前患者病情比较严重,建议还是去三级医院的肝病科咨询检查住院治疗,需要在长期口服抗乙肝病毒药物治疗的基础上保肝退黄利胆治疗,平时不能饮酒,定期复查。