怀二胎，孕48天检查，宫体大小约5.4*4.7*4.4CM，

问题分析：你好，平时月经周期是多少天？月经周期长可能胎囊就小，现在有胎芽及胎心搏动，观察吧。胚胎的胎盘合体滋养细胞能合成多种激素、酶、和细胞因子，对维持正常妊娠起重要作用。绒毛膜促性腺激素是受精后第六日滋养细胞开始分泌微量hcg，在受精后10日可在母血中测出，着床后10周达高峰，持续10日迅速下降，产后2周消失。孕酮，妊娠早期由卵巢妊娠黄体产生。妊娠8-10周后，胎盘合体滋养细胞是产生孕激素的主要来源。孕酮值随妊娠进展逐渐增高。
你好，孕12周内，孕酮水平低，早期流产风险高。建议你黄体酮保胎治疗。孕期加强营养，保持心情愉快，现在口服叶酸片直至3个月末。定期产前检查。

问题分析：孕囊小有两种原因一种考虑可能是，受孕较晚，另一种是发育不良。受孕较晚的话跟本身的月经周期有关。发育不良的话跟体内孕激素水平有关。
根据您目前的孕酮数值，孕酮属于偏低，需要黄体酮积极的保胎治疗，然后定期复查。

问题分析：你好，从你所述目前可初步判断为宫腔内早孕，活胎，由于你平时月经周期，末次月经日期及最早测出怀孕的具体的时间你未提供，不能准确判断你受孕时间的早晚。
如果月经周期长，受孕时间晚可致妊娠囊小于停经天数，但属于正常情况，妊娠囊质量不好，这个诊断不科学，数据指标低目前你没有腹痛，出血等不适症状，建议你定期复查，