我儿子手指甲变形，凹凸不平。这二院做的检查是灰指甲...

问题分析：灰指甲是由真菌感染引起，镜检或者培养出真菌才能确诊。但是不是每一次检查都能得出阳性结果，有的检查多次才会找到真菌。因此在西京和延安没查出真菌，在二院查出真菌，这两种情况并不矛盾。一旦查到真菌，按照真菌感染治疗是没有错的。
你提到的两种外用药物按照医嘱或者说明用药即可。也可以口服药物如伊曲康唑或者特比萘芬等。

问题分析：是不是灰指甲要靠真菌镜检来确诊，你这个做过真菌镜检吗？
如果是灰指甲的话，要应用抗真菌药物，去特比萘芬、伊曲康唑等。

问题分析：灰指甲是由于真菌感染引起的指甲异常病变。可以通过局部用药或者拔甲等针对性治疗。
对于用药同时要注意个人卫生，避免辛辣刺激性饮食，注意个人卫生，不要鞋袜跟别人交叉感染，灰指甲本身属于真菌感染，不宜彻底治愈，容易复发，容易传染其他指甲。