问题分析：患者的尿液呈现深褐色，这可能是由于生理因素所致，也可能是由于膀胱结石、肾结石等病理性因素所致，因此需要对病因进行明确，并给予恰当的治疗。
1、当患者在近期大量摄入含有色素的食物，如红萝卜、火龙果、橘子等时，这些食物中的色素会通过尿液排出，从而导致尿液呈现出深色。若无明显不适症状，一般属于正常现象，无需特别治疗，可通过限制摄入色素含量较高的食物来缓解症状。
2、泌尿系感染、异物侵入膀胱以及下尿路阻塞等因素，均可能导致膀胱结石形成。患者可自行使用药物溶解或者注射破石剂进行清除结石。在患病后，膀胱内的结石将通过尿液排出，然而在此过程中，若结石体积较大，常规情况下需施行外科手术以治疗。
3、肾结石的发病原因多种多样，包括但不限于饮食习惯不当、遗传因素、环境因素等多种因素。如果病情较为严重，则需要及时去医院检查治疗，避免发生肾功能衰竭或者死亡。通常情况下，对于症状较为轻微的患者，通过增加饮水量可以有效缓解其症状；若症状呈现严重程度，一般需实施外科手术以治疗。
