问题分析：对于牙龈萎缩肿痛，可以采取以下措施进行治疗：
1.去除刺激因素，避免食用过冷过热以及酸性食物饮料，减少刺激。
2.药物治疗，在医生指导下，可以外用氟化钠甘油糊剂，内服甲硝唑片、人工牛黄甲硝唑胶囊、头孢克肟片等消炎药物，以控制感染，减轻疼痛。
3.进行超声波洁牙、龈下刮治等专业牙周治疗，清除牙菌斑和牙石，改善牙龈炎症。
4.如牙龈萎缩伴随牙周炎，则需要规范牙周治疗，必要时进行根管治疗。
5.检查是否存在不良修复体，必要时进行改正，调整修复体使其与牙龈严丝合缝。
6.萎缩牙龈也可能与不正畸力相关，需要评估是否需要进行正畸治疗。
7.培养良好的口腔卫生习惯，早晚刷牙，饭后漱口。
综上所述，牙龈萎缩肿痛的治疗需要识别病因，采取消炎止痛、专业牙周治疗、修复体调整、正畸治疗等综合措施，同时保持良好的口腔卫生习惯，以期达到镇痛和牙龈健康的目标。
