问题分析:巧克力囊肿由于子宫内膜异位到卵巢引起的,如果囊肿面积小,是可以怀孕的,而且怀孕后有所缓解,因为怀孕之后没有了月经,巧克力囊肿得不到补充就会缩小直到消失。如果囊肿面积大于5厘米,会影响到输卵管的功能而导致不孕,建议可以选择中药调理或者手术治疗,中药调理比较慢,可以选择腹腔镜手术治疗,如果术后保留的卵巢较完整是不会影响怀孕的,建议休息1-2个月怀孕。