问题分析:如果患有子宫内膜异位症和巧克力囊肿,首先可以让患者保守进行治疗,建议选择一些中成药来进行调理,可以用桂枝茯苓丸进行调理;也可以让中医大夫为患者开具中药汤剂,但是需要望闻问切辨证论治,这样才会发挥最大的疗效。如果局部疼痛比较严重,也可以在子宫内部放置左炔诺孕酮环,这种药物能够调理身体的激素水平,能够减少疼痛的症状。如果进行保守治疗仍然不能使症状缓解,就只能考虑进行手术切除了。