问题分析：根据所述，慢性乙型肝炎诊断明确，目前口服阿德福韦抗病毒治疗过程中。近期体检显示肝囊肿，合并肝内结节。超声提示，右肾结石。拟明确结节的性质及进一步诊疗方案。
指导建议：1）慢性乙型肝炎抗病毒治疗过程中，可继续到感染科或肝病科就诊。2）单纯根据超声检查，目前应该在慢性肝炎阶段。肝内结节是增生性还是肿瘤性，原则上仅根据超声结果难以明确。进一步的化验及检查，有助于肝内结节的良恶性鉴别。这些化验包括，AFP、AFP-L3，DCP，CEA，CA19-9等。3）对于肝内结节，腹部增强CT是最佳策略，但直径低于1.0cm的结节，鉴别诊断困难。4）建议3-6个月复查。
