问题分析：您好，对于你的这种情况应该是以医院的治疗方案为准的。
意见建议：三级医院的医生那才是真正的专家，他们的水平远比你百度上的那些答案要准的。

月经干净后，或者月经期间都可以的，主要的检查项目包括内分泌检查、B超检查等内容。巧克力囊肿如果增长速度比较快，是需要考虑手术治疗的。当囊肿伴有出血、感染和恶性转化时，表现出异质性，CT值增加。

这和每个人对药物的敏感程度和吸收能力是不一样的。有的人打完一针以后就不会来月经了，或者是到来月经的时候出现少量的阴道流血；也有的人在打完三针以后才会出现不来月经。但是，不管来不来月经，都要在两次用药之间间隔28天就需要打针的，不然效果是不好的。一般应用时间最长是六个月，也就是超过六个月以后必须要停药等待自然恢复月经。

由于术后的前3个月比较重要，所以一般都可以术后打2-3次针，一个月1次，打针过程中一般月经不会来潮的，停针后会恢复的，定期做好检查腹部B超，看看子宫附件。平常生活当中要多休息避免劳累和熬夜，要多加强锻炼身体。

做巧克力囊肿手术，应该在月经干净，2到7天内禁欲进行比较好，这样对于手术是有好处的，这个时间段做手术给大夫也会带来很多方便，对于囊肿的切除也会比较干净，因为看的比较清楚。

做巧克力囊肿手术后要等手术恢复以后，可以在一个月以后进行同房性生活，这样对身体不会造成影响，但是在性生活之前需要进行一个复查，来确定巧克力囊肿手术恢复正常后再进行同房。

一般手术后半年之久再考虑备孕。备孕期间女方需要吃叶酸，夫妻双方做一个忧生方面的检查，来尽量避免怀孕后胎儿发育不良，畸形，流产等。另外，腹腔镜手术后一个月内不要吃辛辣、生冷刺激性的食物，不能有性生活，平时要多注意伤口的卫生。一定要定期做复查。

巧克力囊肿主要是因为子宫内膜异位症引起的，如果卵巢内有巧克力囊肿，而且囊肿比较大，是可以考虑手术治疗的。做巧克力囊肿的切除手术再月经干净以后，选择比较正规的医院，做巧克力囊肿的切除手术，手术以后也需要定期复查。

卵巢巧克力囊肿检查时间，通常是在月经干净后马上进行B超检查，这时检查的结果最为准确。可以把两次的检查的结果对照一下，了解一下疾病的情况。及时改变治疗方案，可以尽早地治疗。