月经干净后，或者月经期间都可以的，主要的检查项目包括内分泌检查、B超检查等内容。巧克力囊肿如果增长速度比较快，是需要考虑手术治疗的。当囊肿伴有出血、感染和恶性转化时，表现出异质性，CT值增加。

卵巢巧克力囊肿检查时间，通常是在月经干净后马上进行B超检查，这时检查的结果最为准确。可以把两次的检查的结果对照一下，了解一下疾病的情况。及时改变治疗方案，可以尽早地治疗。