可以选择药物治疗或者康复治疗。药物治疗：包括营养神经药物、增强脑代谢药物等，但疗效较为有限，患者切勿过于依靠药物。功能康复训练可一定程度或很大程度的恢复患者的生活自理能力。

脑炎后遗症的饮食要定时：一般早、午、晚各进食一次，有条件者可以在上下午各增加点心一次，按时进食，可以增加食欲。食物要易吸收、高蛋白：在脑炎后遗症的饮食中食物要容易消化吸收，营养丰富，要选高蛋白质的食物。

中医治疗：此治疗方法主要为针灸和按摩。还有就是物理治疗：小儿脑瘫的药物治疗不是主要的手段，常常作为辅助性对症应用。在婴儿期，可以辅助应用一些神经营养药物。

可以通过脑电图和核磁共振进行检查。脑电图通过安置电极于头颅皮肤，记录脑内发出的电波，癫痫发作，则脑电波发生特征性改变；核磁共振通过3.0T以上高场强核磁共振，可发现大脑结构特征性改变，判断癫痫病灶。

适当运动。改善脑部的血液循环是很重要的，运动对患者极佳，但要适量，并避免太过剧烈的运动，并应尽量避免情绪紧张及压力。如果肠子未每天蠕动，可在睡前喝些柠檬汁，每天还可以服用2汤匙橄榄油润滑疏通肠胃。

病毒分离，病初以血清与脑脊液分离病毒，但阳性率低，死后可取脑组织分离病毒。血象，白细胞1～2万，中性增高。血凝抑制试验，双份血清效价增长4倍以上者或单份血清效价1：320以上可确诊。

症状加仪器诊断比较好。曾患有脑膜炎病史。临床症状出现肢体运动障碍、智力障碍、失语、眼球麻痹、吞咽困难等。结合神经电生理检查、脑脊液检查、脑电图检查、头颅MRI、CT等检查进行诊断。

中医以清热解毒为常法。病之初起治当清热透邪，邪入营血则须清热凉血，若病程迁延，耗气伤阴者治应祛邪扶正兼顾。而中医治疗化脓性脑膜炎的非常多，可以根据自身情况进行针对性的治疗。

抗病毒疗法。干扰素可以提高机体对病毒的抵抗能力均可应用；营养治疗：保证患者日常的均衡营养，多吃新鲜的水果和蔬菜，有利于患者体质的增强，对脑炎后遗症的治疗，和康复有一定辅助作用。