临床表现主要有：痛经，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重，性交疼痛，这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。

通常情况下，卵巢巧克力囊肿的治疗方法有保守治疗、手术治疗等。具体情况分析如下：
保守治疗：卵巢巧克力囊肿是一种由于子宫内膜异位引起的疾病，如果症状比较轻，可以通过高效孕激素周期治疗、假孕疗法、假绝经疗法等保守方法进行治疗。
手术治疗：如果症状比较严重，保守治疗无效，可以通过手术尽量切除病灶；如果没有生育要求，可以直接切除子宫。

如果说有卵巢囊肿，是不会影响到工作的，饮食上面要注意尽量不要吃辛辣刺激性的食物，有巧克力囊肿其实是可以通过规律的服用药物来治疗的。卵巢巧克力囊肿饮食宜多吃具有抗肿瘤作用的食物。

卵巢巧克力囊肿指标有子宫直肠陷窝，可触及大小不等的不规则的结节状突起，触痛明显，子宫骶骨韧带增厚压痛。异位卵巢时常可触及一侧或两侧盆腔内有固定的囊性肿块，伴或不伴压痛。

巧克力囊肿会出现痛经，痛经是巧克力囊肿最主要的症状；出现月经不调的症状；同房时发生疼痛感觉；会导致不孕症的发生；发生腹膜炎症。及时的到医院进行检查，可以把身体的病情降低到最低，危害性降到最低。

跟肥胖，压力大，休息不好，内分泌紊乱等方面有关，有性激素水平异常，排卵障碍，月经紊乱等症状表现。女性月经期一定要杜绝性生活。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动。随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要去正规医院进行治疗，不要耽误治疗时期。

以腹腔镜确诊、手术加上药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。治疗时需要去正规大医院。

巧克力囊肿食疗禁食辛辣生冷刺激，增加营养，多吃瘦肉，鸡蛋，牛奶，海产品等优质蛋白，多吃蔬菜水果，多吃豆制食品，适当活动，避免剧烈运动，注意手术后一个月禁忌性生活，每晚温水冲洗外阴，保持外阴清洁干燥，有不适及时去医院检查。

主要是具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢上，并且随着卵巢周期性的变化而发生变化，比如在周期性的子宫内膜脱落出血形成临床月经的时候，种植在卵巢上的子宫内膜也会出现周期性的出血现象。