乙肝疫苗孩子发烧39需要去医院的儿科检查一下，排除有无受凉感冒或过敏性紫癜的情况。给孩子多喂开水，饮食上吃些好消化，忌辛辣和凉的食物，这段时间多休息，检查清楚在及时配合治疗一下。

病情分析： 注射乙肝疫苗后常出现的副作用是：发烧、皮疹、胃肠反应等，一般症状比较轻微，多无需处理。
意见建议：注射乙肝疫苗后，短时间内可以使机体抵抗力下降，如果先前得了急病会更加加重，也会更容易患病。孩子鼻子不通气、打喷嚏、发烧是感冒的症状，可能是打针时冻着着凉引起的，建议紧着使用抗感冒药物，适当予以退烧。