问题分析：脑脊膜膨出是一种先天性神经管畸形，通常需要通过手术干预来治疗。对于您描述的12岁患者，膨出长度为三厘米的情况，手术是首选的治疗方式，目的是修复神经组织缺损并封闭脊柱裂口，以防止神经进一步受损和感染。
手术通常在患儿出生后尽早进行，但若症状较轻或未及时处理，也可在儿童期进行。手术方案需由神经外科医生根据影像学检查（如MRI）结果制定，可能包括切除膨出囊、修复硬脊膜缺损、减压神经根以及脊柱融合术等。术后需密切监测神经功能恢复情况，并可能配合康复训练。
此外，患者需注意预防感染，避免剧烈运动，并定期随访评估神经功能。如果存在脑积水或其他并发症，可能需要联合治疗。建议尽快前往正规医院的神经外科就诊，由专业医生制定个性化治疗方案。