问题分析：您好，根据您提供的停经40天和孕囊0.3x0.3cm的数据，这属于典型的早期妊娠表现。
从医学角度来看，停经天数与B超下的孕囊大小通常存在一定的对应关系。0.3x0.3cm的孕囊大小，通常对应怀孕大约5-6周左右的时间。由于每个女性的月经周期和排卵时间存在个体差异，这种推算通常会有1-2周的误差范围。
建议您不必过于焦虑，可以结合您的末次月经日期进行综合判断。如果末次月经日期确实在40天左右，那么目前的孕囊大小是符合孕周的。接下来请遵医嘱定期进行B超复查，以监测胎芽和胎心搏动的情况，确保胚胎发育正常。