3个月宝宝腹泻可遵医嘱口服肠道益生菌、蒙脱石散治疗。
3个月宝宝腹泻与肠道菌群失衡有关，调节肠道菌群失常，家长可以在医生指导下给宝宝口服肠道益生菌。口服益生菌能够提高肠道抵抗力，增加肠道中有益菌的存在，促进肠道功能恢复，缓解腹泻，提高宝宝的免疫力。
腹泻比较严重的患者适当服用蒙脱石散，可以吸附肠道中的病毒和细菌，改善肠道细胞的吸收和分泌功能。

宝宝吃母乳腹泻可以遵医嘱使用药物进行治疗。
宝宝吃了母乳会拉肚子，这属于一种生理的拉肚子，因为母乳属于流食，宝宝的消化能力强，所以宝宝会有拉肚子的症状。也可能是因为对母乳的敏感引起的，可以口服一些可以调节消化道的药物，例如枯草杆菌二联活菌颗粒，但千万别乱吃，以免加重宝宝的胃肠负担。同时需要停止哺乳，可以选择用牛奶替代母乳喂养。

这种时候要立刻暂停母乳，然后母亲调节一下饮食，再给宝宝进行母乳试试看。产生这个现象的原因是因为母乳中含有的脂肪含量比较高，而且母亲如果吃了生冷寒凉的食物，就会导致母乳中含有的寒凉物质比较多，宝宝食用了母乳以后腹泻。在给宝宝哺乳阶段，母亲应该注意避免食用生冷寒凉的食物。

检查化验大便是因为消化不良还是因为肠炎，同时在此期间要多喝温水，不吃凉的不易消化的东西，顺时针给按摩肚子，促进肠胃蠕动，可以很好的缓解腹胀的现象。同时母乳喂养的宝宝也要注意妈妈的饮食。

如果要是严重，还是要去医院然后进行治疗。当然可以服用一些药物。它主要是针对小孩儿脾气虚弱。上吐下泻。多补充有营养的物质。睡眠也要保持充足，这些可能会增强宝宝的免疫力。

当婴儿在母乳时，妈妈不要吃辛辣刺激，或者太冷的东西，这些都对孩子的肠胃有很大的伤害。当孩子在吃奶的时期，如果妈妈吴吃了不该吃的，那么就会造成孩子的腹泻，因为孩子吃的东西都是妈妈间接给孩子的。当妈妈吃什么东西时，那么孩子就会间接地吃了妈妈所吃的东西。这种腹泻不会伴有发热症状，婴儿无痛苦无哭闹，也没有感染方面的异常，婴儿精神状态佳，食欲无变化，生长发育不受影响。即使腹泻病程长，但体重仍然呈增长态势。这是因为母乳中较多的“前列腺素E2”会增加小肠平滑肌的运动，增加婴儿体内水分和电解质的分泌，从而造成腹泻。

纯母乳喂养婴儿腹泻家长应及时将宝宝的大便送检：平时在家中备上一个医院化验便常规使用的便盒，不要刮取尿不湿上的大便，留取大便后需要在半小时以内送检，如果大便化验可见白细胞，多为侵袭性细菌感染，当抗生素治疗效果不好，或病情反复时，应及时做大便培养。大便化验未见白细胞，多为病毒感染或非感染性腹泻，最严重的是脱水及电解质酸碱失衡。

通常情况下，5个月婴儿腹泻，家长可以通过使用药物、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：5个月婴儿腹泻，家长可以按照医嘱给5个月的婴儿使用藿香正气滴丸、止泻保童颗粒、胃肠安丸等药物进行治疗。
日常护理：5个月婴儿腹泻，家长应注意及时给婴儿添衣，多给婴儿喝水，注意保持婴儿的房间温度适宜，顺时针按摩婴儿的腹部，以促进婴儿身体的恢复。

吃母乳婴儿腹泻大便，如果宝宝没有哭闹等不适，精神状态好，胃口好，身高和体重增长都很正常，这是正常的，不需要特别的处理，等过了一个月，这种情况就会逐渐消失。
如果宝宝食欲不佳，出现脱水症状，可以通过口服肠道益生菌来调节肠道菌群的平衡。比如双歧三联活菌散、乳酸菌素片等。在孩子拉肚子的时候，妈妈要避免吃生冷辛辣的食物。如果孩子的腹泻症状减轻了，可以适当的调节一下自己的饮食。